Иммунные свойства древней ДНК, обнаруженные в изолированных деревнях, могут принести пользу человечеству сегодня

Могут ли остатки ДНК из вымершего ныне подвида человека, известного как денисовцы, помочь повысить иммунные функции современных людей?

Международное исследование под руководством Исследовательского института трансляционной геномики (TGen), филиала City of Hope и опубликованное в научном журнале PLOS Genetics, представляет первые характеристики генов в ДНК здоровых людей из географически и генетически различных групп населения в Индонезии, сообщает медицинский портал forumssity.ru.

Ученые изучили геномное разнообразие среди 116 особей из трех индонезийских популяций: ментавай на западном побережье Суматры; Сумба в центральной Индонезии; и Коровай, группа охотников-собирателей с западной стороны острова Новая Гвинея.

Коровай представляют особый интерес, поскольку их ДНК содержит последние оставшиеся в мире значимые остатки генетического кода - до 5% - от двоюродного брата современных людей, называемого денисовцами, говорится в исследовании. Как и более известные неандертальцы Европы, денисовцы в Азии также являются вымершим человеческим подвидом, который жил десятки тысяч лет назад. И точно так же, как неандертальцы передали определенные иммунные свойства европейским предкам, денисовцы, возможно, передали защитные иммунные гены своим потомкам из Юго-Восточной Азии.

«Усилия по секвенированию генома были в основном сосредоточены на популяциях европейского происхождения», - сказал доктор Хейни Натри, научный сотрудник TGen и один из ведущих авторов исследования. «Большая часть мира глубоко изучена. По мере того, как мы продвигаемся в эпоху персонализированной и геномной медицины, понимание того, как генетика ведет к риску заболеваний среди различных групп населения, становится чрезвычайно важным».

Зачем изучать Индонезию?

Распространенный на более чем 17 000 островов между материковой Азией и Австралией, Индонезия является крупнейшим в мире архипелагом. Географически столь же большой, как США или Европа, 273 миллиона жителей Индонезии делают ее четвертой по численности населения страной в мире после Китая, Индии и США. И все же Индонезия была в значительной степени исключена из бума секвенирования геномики прошлого десятилетия, и там ранее не было никакого анализа разнообразия в регулировании генов ни в Индонезии, ни в других островных государствах Юго-Восточной Азии.

«Этот недостаток информации из Индонезии вызывает тревогу, поскольку он является эпицентром разнообразия инфекционных заболеваний, таких как малярия и другие возникающие тропические заболевания», - сказал д-р Натри. «Иммунное давление от инфекционных заболеваний является причиной одних из самых сильных селективных воздействий на человека на протяжении всей эволюционной истории нашего вида, и Индонезия предлагает уникальные преимущества для изучения реакции на эти заболевания».

Из-за островной среды Индонезии, ее многочисленных изолированных деревень и относительно низкой плотности населения на большинстве почти 6000 населенных островов, исследование показывает, что генетическое разнообразие среди тех, кто живет на каждом острове и даже в каждой деревне, является низким, но также генетическое разнообразие людей от острова к острову, «что делает его почти уникальной системой изучения для изучения взаимодействия генов с окружающей средой», говорится в исследовании.

Ученые концентрируются на иммунных свойствах древней ДНК человека

Доктор Николас Банович, доцент кафедры геномики интегрированного рака TGen, человек-генетик, и старший автор этой статьи PLOS Genetics , сказал, что результаты исследования выделяют гены, вовлеченные в функцию иммунных клеток. Это предполагает потенциально адаптивную реакцию на местные нагрузки на окружающую среду, включая нагрузки от различных тропических болезней.

«Одним из уникальных аспектов Индонезии является то, что люди на острове Новая Гвинея имеют высокие остатки ДНК от одного из наших вымерших предков, денисовцев», - сказал д-р Банович. «Мы обнаружили, что эти остатки древней ДНК приводят к изменениям в генах, вовлеченных в иммунную функцию. Это исследование демонстрирует силу включения недостаточно изученных популяций в стремление улучшить общее понимание генетики человека».

Международная группа продолжает свое исследование, объединяя больше генетических данных, исследуя закономерности местного происхождения и то, как архаичные гены человека внедряются в современную популяцию.

«Сейчас мы пытаемся определить индивидуальные генетические изменения - в частности, те, которые переносятся в этих остатках ДНК от Denisovans, - которые регулируют, сколько или как мало гена включено, и как эти генетические изменения могут формировать иммунитет ответ ", сказал доктор Натри.